Справившись с Боузером и защитив Бруклин, Марио снова оказывается в центре событий. На этот раз ему противостоит опасный союз — коварные Варио объединились с Боузером-младшим. Их амбиции простираются далеко: они задумали подчинить себе весь мир. Марио не одинок — верные друзья и неутомимый Йоши готовы помочь. Вместе им предстоит найти способ сорвать грандиозные и угрожающие планы этой неожиданной коалиции.